LANGKAH 1 adalah untuk pertama unzip DS-DNA, juga disebut denaturasi, menjadi dua untai tunggal komplementer DNA dengan memanaskan campuran reaksi 95 derajat Celcius. LANGKAH 2 isolat daerah target DNA Genomic dengan menempelkan 2 primer (P1 & P2 ) yang sama persis keduanya 20-30 pasangan basa daerah unik yang diakhiri di DNa sasaran. Sekali waktu diizinkan untuk primer untuk mendarat di situs, LANGKAH 3 dilakukan dengan pemanasan campuran untuk 72 derajat di mana titik polimerase khusus membangun untai DNA dimulai pada primer dan terus ke arah 5 prima, proses ini disebut ekstensi.
Ketiga langkah ini diulang 25-40 kali untuk menghasilkan jutaan salinan tepat dari daerah target DNA , karena selama siklus kedua proses ini, ekstensi dapat terjadi pada kedua salinan asli dari DNA genomik dan potongan-potongan terbaru (yang berwarna dalam diagram) ekstensi selanjutnya dengan cepat terbatas tepat untuk daerah target (A).
